选择抗病品种是防治玉米链格孢菌叶枯病的基础。选用抗病品种可有效降低病害发生的可能性。此外，合理的施肥管理也是防治该病的重要措施。在施肥过程中，应注意控制氮肥的施用量，减少植株的营养储备，从而减少病害发生的可能性。

在病害早期，可以采用药物进行防治。首选的药物为三唑酮等杀菌剂。但是，为了保护生态环境和人体健康，药物的使用必须按照标准剂量和方法使用，避免滥用和误用。此外，药物防治也应在天气稳定、风速小的时候进行，以充分发挥药物的防治效果。

改善玉米种植环境也可以有效预防链格孢菌叶枯病的发生。在播种前，应对土壤进行消毒处理，清除土壤中的病原体和病害菌。同时，注意间作和轮作，避免连作玉米，减少病害的传播和积累。